- Suytumachay
- Sacoj
- Sacsa
- Sacsachuco
- Salazar
- San José de Andaychagua
- San Miguel
- San Pedro
- Sanglar
- Santa Ana Viejo
- Santa Rosa de Sacco
- Santo Domingo
- Sapatococha
- Severino Puquio
- Shagata
- Shalapucro
- Shalguag
- Shicashuachuco
- Shinca
- Shincacancha
- Shinigayoc
- Shipunahuain
- Shiricalpa
- Shiricancha
- Shiusha
- Shoclay
- Shuctupayana
- Shugumpi
- Shugupuquio
- Shullupuquio